厭氧菌在有氧的情況下不能生長。要培養厭氧菌，必須創造一個無氧的環境。通常用加入還原劑的培養基，或用物理、化學方法去除環境中的游離氧，以降低氧化還原電勢。如皰肉培養基、硫基乙酸鈉培養基，牛心腦浸液培養基等。常用的厭氧培養方法有許多，可根據實際情況選用。
1.厭氧缸法：接種好標本的平板或液體培養基試管，可放入厭氧缸內培養，厭氧缸是普通的干燥缸，用物理化學的方法使缸內造成厭氧環境，從而將厭氧菌培養出來。
2.厭氧袋：即在塑料袋內造成厭氧環境來培養厭氧菌。塑料袋透明而不透氣，內裝氣體發生管(有NaBH4的碳酸氫鈉固體以及5%檸檬酸安瓿)、美蘭指示劑管、鈀催化劑管、干燥劑。放入已接種好的平板后，盡量擠出袋內空氣，然后密封袋口。先折斷氣體發生管，后折斷美蘭指示劑管，命名袋內在半小時內造成無氣環境。如不突變表示袋內已達厭氧狀態，可以孵育。
3.厭氧盒：原理同厭氧袋，有成品銷售。
4.厭氧培養裝置：用于制造厭氧(氧濃度為0%)、微需氧(氧濃度為6%)和特殊氧氣濃度(1%-18%)比例的厭氧和微需氧環境，適用于厭氧菌、微需氧菌和細胞培養等；用于食品安全國家標準GB4789要求的空腸彎曲菌，溶血性鏈球菌，雙歧桿菌，乳酸菌和志賀氏菌檢測；還可用于飲用天然礦泉水中的產氣莢膜梭菌等需要厭氧、微需氧及特殊氧氣濃度培養菌的分離培養；
HD-AN200型智能厭氧培養裝置用于食品安全國家標準GB4789要求的空腸彎曲菌，溶血性鏈球菌，雙歧桿菌，乳酸菌和志賀氏菌檢測；還可用于飲用天然礦泉水中的產氣莢膜梭菌等需要厭氧、微需氧及特殊氧氣濃度培養菌的分離培養。
5.生物耗氧法：在一密閉的容器內放以生物(多是植物)，消耗氧氣，同時產生二氧化碳，供細菌生長用。
6.焦性末食子酸法：在一潔凈的玻片上鋪上紗布或濾紙，均勻撒上焦性末食子酸，然后再混入NaHCO3粉末或NaOH溶液，迅速將已接種細菌的平板倒扣在上面，用融化的白蠟封邊，造成一個封閉空間。焦性末食子酸與堿反應后耗氧。該法用于厭氧不嚴格的厭氧菌的培養，簡單。如有梭狀芽孢桿菌。
7.皰肉培養基：本身就是一個不需特殊設備的厭氧培養法。皰肉和肉湯裝入大試管，液面封凡士林，造成無氧環境
